文献管理
mendely停止移动端服务之后发生的事情
软件选择
2021.3.15号mendely停止服务,其实我在一段时间之前就注意到这个事情了。但是今天晚上睡前拿出Ipad打开mendeley一看,打不开,哦,这才发现要处理这个问题了。
我对文献管理软件的要求是:
- 能适配word,并且自动更改引用格式。
其实这一条就应该去掉Mendeley了,他的格式识别很有问题,并且这个东西经常在Mac的Word上卡顿;除此之外,Word对公式和图片的支持也不是很好,所以最好他能导出Biblitex或者直接支持Latex。
- 不要让我操太多心,付费可以。
这条去掉zotero和Marginote。
其实我非常羡慕Marginote的那个脑图,很符合人脑的思维模式。我现在脑子里就有更新之前的几篇AB的想法,但是直接更新的话长年累月就变成了粪坑,开新的话就搞得太多了写论文的时候也很难找。最直接的做AB的办法就是直接在文献管理软件里直接Annotate。
但是Marginote就太小作坊了,很容易出问题,zotero则跟python一样要搞各种插件,算了算了累了累了。
- 全平台同步
其实文件同步很容易,重要的是Annotation的同步,这条直接去掉Marginote。
- 插入文献搜索的时候能搜索到我的Annotation。。
这条好像真的挺难的。
- 能自动提取文献相关信息
查了好多测评,papers似乎是准确率最高的那个
这么查来查去,好像就剩下Papers能用了。好在他还有个三十天付费,先试试吧。
对了,Mendeley转到其他平台的话,还要记得先降级,真的是垃圾软件。果然世界上没有免费的午餐。而且我这么一转的话之前做的好多标记也都没了。还好我读的文献也不多,而且很多我觉得重要的文献要么打印要么做了AB。
猛然发现自己做AB的Flag已经倒了好久了,哎,自己最近状态确实不好,最近两个月大概。
Papers 试用
自己大概一共有一千多篇文献,导入速度还是挺快的,尤其好评的是如果自己用的是Mendeley导出的带Annotation版本的文献,那么导入到Papers里面也会有。而且文献识别非常准确
唯一麻烦的地方就是因为这个东西全程联网,并不是调用本地的papers软件来插入,而是利用你帐号的数据库,在用Word插入的时候非常慢,而且不能通过搜索Annotation来进行插入,并且还不能离线。
这好像已经不是唯一的麻烦了hhhh,特别是只能在线这一条,真的就很烦。
那这样和我用Latex写有啥区别,速度还快。
别骂了别骂了,已经在安装Latex了。大概是这个https://humanlee1011.github.io/2019/02/25/MacTex/
所以我最后大概可能的流程是
Mendeley 读论文。
Onedrive/papership同步。
导出Bibtex。
VScode写论文
笔记软件
在实验室不想干活的下午收拾笔记应用。
对我而言,onenote已经完全沦为我的日记软件了,上面有着我从本科开始的所有日记(几乎)
另外一部分在手机便签上,但是这种便签最大的不方便的地方就是你换了手机就很难同步。
这次找笔记应用主要是为了以下几个方面
- 看论文。方便我写Annotation,最好能导出Markdown,这样我可以直接发到博客里面。
- 支持多端同步,这样我在手机上想起来论文的时候也可以查一下,正好也可以替代本地的便签。
- 支持全局搜索和双向链接,这是因为看了notion和marginote非常眼馋。
最后决定用了思源笔记,别的不说,就发布在github上面的这个调性就非常对我胃口。
反正免费版看起来就很不错了。先试试吧。
不过说真的 上手难度真的有点高
被迫转移到zotero
前几天发生了一件让我大无语的事,某天打开mendeley的时候所有论文都变成这样的了
这意味着这些论文都不在本地了。而我去检查了一下我放参考文献的那几个文件夹,一点事都没有。
被迫转到zotero了。
Papers必须在线使用这一点真的太烦人了,如果不介意这个用Papers还是很舒服的。
mendely转移到zoetero的步骤
1.下载好mendely里面的文献
因为我的文献都被搞出本地了,所以我必须得先把它们下回来,参照这个的方法,先装好对应版本的mendely,再去全选,点Edit settings,把那个同步所有文件Synchronize attached files都给选上。
2.导出
看了一圈感觉还真的没一个能打的,侧面反映了搞科研的都是穷鬼,所以我还是得用zotero。为了导出我之前做的注解和标记,在这一步需要把他降级到1.19.4或者更以前的。在这个版本之后的mendely会把你的注解和标记以另外的格式存储,而不是放在pdf里面。
弄完了之后全选,然后选那个export with annotation。
3.导入
我跟的的这个方法,虽然我也不是很懂RIS到底是啥
6.17完全导入方法
终于搞定了就zotero的完全导入。
首先把你库里的东西全都同步到账户上,然后卸载,安装1.17或者更以前版本的mendely,接着登陆你的账号把库里的东西同步下来,然后在help里backup一次,最后打开zotero, import里面import from mendely。
这个可以保持你在mendely里的所有东西,包括subfolder啥的之类的
Zotero 插件
所有的插件基本都能在这里找到
Zotfile
下完之后打开tools-add on,小齿轮install add on from files,选择下好那个就行了。
然后tool那里选择zotfile设置一下,最后全选然后右键manage attachment选rename即可
zotero storage scanner
跟上面一样的安装方法,安装完之后去tool那里选一下storage scanner就会自动运行
Zotero Scholar Citations (ZSC)
跟上面一样,装完点一下就行
自己后来又装了几个,不太需要进行特别的设置,我截个图吧。
榛子分享会
安利一下榛子的自习室
让我来试着做个课代表
来晚了呜呜呜
榛子计算机功底好好,但是感觉她有点暴躁怎么回事。
查文献
这里榛子在疯狂推荐Research Rrabbi
u1s1我也觉得这个非常好用
然后还推荐了一下Aminer,我用了一下这个trend
感觉还挺准的,虽然我还真不知道12年那里出现了啥
我有点怀疑他是某个组的学生
草 他说了句是我老板的一个东西,怀疑对了
Research Rabbit导出Bib,zotero直接import nib,然后右键find available PDF
看论文
看intro和con知道他在讲什么
看TOC知道我们应该看那一部分
如果Ref是用数字引用的,几乎可以通过看Ref看出来这篇论文在讲什么。看他们Intro引用了什么你用引用啥的
读东西一定要写东西,consume一定要produce
写论文
Digital Gardern,
用思源笔记来写Ano. B, 想他们会怎么用,直接在Obsidian里做链接
榛子真厉害!
Disable Mendely plugin
我把mendely卸载了之后,那个plugin还在word里,搞得word崩溃了好几次,我查了查卸载它还需要在mendeley里卸载,但是我都卸载了???您搁着隔着呢?
查了查,就只能这样了,但是记得要重新安装1.18以上的版本。
真的有点恶心。
MAC to Windows
本来这一篇应该是在回国之后就立刻搞的,但是因为我实在太懒,再加上一直没有动力去搞学术,就搁置了。
问题的情况我自己一直解决不了,发到了zotero forum ,然后得到的答复是我需要在mac下改变路径再用Windows,但是现在我的mac已经没得了...
所以就只能继续使用传统的导入方法,正好整理一下之前的论文,之前的实在太乱了
太久了,先把zotero升级到6.0,然后下了一堆插件
因为有几个还没适配Version6 比如mdnote 就没安装
然后用import from folder 导入了原来所有在attachement里面的文件 这个过程 我这两千多个要花好久。。。扫描了一整个晚上
另外这里还有一个obsidian的plugin我没弄 也许后面会用到 先放在这里https://github.com/hans/obsidian-citation-plugin
弄完之后全选点邮件 Retrieve metadata from pdf,这个过程注意是只能搞中文的 必须在能够直连google scholar的网络环境下进行,这个功能总体还是挺难用的。